Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnnc2P20801 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms