Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prim1P20664 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Prim1P20664 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prim1P20664 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prim1P20664 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prim1P20664 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prim1P20664 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prim1P20664 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prim1P20664 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim1P20664 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prim1P20664 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms