Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fcer1aP20489 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fcer1aP20489 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms