Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP20293 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP20293 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP20293 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP20293 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP20293 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP20293 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP20293 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP20293 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP20293 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP20293 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP20293 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP20293 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TP20293 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP20293 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP20293 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP20293 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP20293 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP20293 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP20293 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP20293 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP20293 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP20293 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TP20293 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP20293 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP20293 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP20293 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP20293 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TP20293 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP20293 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TP20293 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TP20293 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TP20293 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP20293 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP20293 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP20293 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP20293 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP20293 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP20293 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP20293 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP20293 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TP20293 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TP20293 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP20293 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP20293 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP20293 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP20293 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP20293 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP20293 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP20293 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP20293 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP20293 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP20293 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TP20293 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP20293 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TP20293 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TP20293 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TP20293 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TP20293 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP20293 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP20293 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP20293 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP20293 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP20293 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP20293 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP20293 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP20293 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP20293 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP20293 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP20293 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP20293 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP20293 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP20293 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP20293 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP20293 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP20293 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TP20293 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP20293 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms