Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnc1P19123 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnc1P19123 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms