Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpraP18052 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpraP18052 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtpraP18052 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpraP18052 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpraP18052 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpraP18052 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PtpraP18052 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PtpraP18052 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtpraP18052 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PtpraP18052 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtpraP18052 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtpraP18052 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PtpraP18052 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtpraP18052 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtpraP18052 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtpraP18052 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PtpraP18052 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PtpraP18052 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtpraP18052 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtpraP18052 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtpraP18052 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtpraP18052 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms