Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sptan1P16546 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptan1P16546 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms