Protein–RNA interactions for Protein: P15530

Cd79b, B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd79bP15530 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd79bP15530 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd79bP15530 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms