Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Dnmt1P13864 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Dnmt1P13864 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Dnmt1P13864 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Dnmt1P13864 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms