Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd5P13379 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd5P13379 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd5P13379 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd5P13379 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd5P13379 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cd5P13379 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms