Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Vpreb2P13373 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vpreb2P13373 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms