Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcl1P12850 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcl1P12850 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms