Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nr4a1P12813 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nr4a1P12813 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms