Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timp1P12032 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timp1P12032 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Timp1P12032 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timp1P12032 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Timp1P12032 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timp1P12032 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Timp1P12032 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timp1P12032 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timp1P12032 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timp1P12032 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timp1P12032 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timp1P12032 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timp1P12032 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timp1P12032 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp1P12032 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp1P12032 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Timp1P12032 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Timp1P12032 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Timp1P12032 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Timp1P12032 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Timp1P12032 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms