Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga5P11688 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga5P11688 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga5P11688 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga5P11688 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga5P11688 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga5P11688 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga5P11688 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Itga5P11688 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms