Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fgf4P11403 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf4P11403 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf4P11403 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf4P11403 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fgf4P11403 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf4P11403 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf4P11403 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf4P11403 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf4P11403 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf4P11403 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fgf4P11403 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf4P11403 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf4P11403 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf4P11403 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf4P11403 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf4P11403 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf4P11403 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf4P11403 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf4P11403 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf4P11403 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Fgf4P11403 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf4P11403 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf4P11403 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf4P11403 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf4P11403 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf4P11403 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fgf4P11403 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf4P11403 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf4P11403 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf4P11403 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf4P11403 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf4P11403 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf4P11403 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf4P11403 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf4P11403 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fgf4P11403 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms