Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd4P10628 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd4P10628 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms