Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb4P10284 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms