Protein–RNA interactions for Protein: P09926

Surf2, Surfeit locus protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf2P09926 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Surf2P09926 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf2P09926 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf2P09926 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Surf2P09926 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Surf2P09926 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms