Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Surf1P09925 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf1P09925 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf1P09925 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf1P09925 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf1P09925 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf1P09925 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf1P09925 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Surf1P09925 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Surf1P09925 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Surf1P09925 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Surf1P09925 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf1P09925 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Surf1P09925 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms