Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxb7P09024 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hoxb7P09024 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hoxb7P09024 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hoxb7P09024 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms