Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spta1P08032 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spta1P08032 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spta1P08032 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spta1P08032 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spta1P08032 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Spta1P08032 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spta1P08032 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spta1P08032 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spta1P08032 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spta1P08032 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spta1P08032 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spta1P08032 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms