Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb1P04230 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms