Protein–RNA interactions for Protein: P01806

Ig heavy chain V region 441, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01806 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01806 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01806 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01806 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01806 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01806 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01806 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01806 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01806 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01806 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01806 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01806 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01806 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01806 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01806 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01806 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01806 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01806 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
P01806 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01806 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01806 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01806 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01806 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01806 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01806 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01806 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01806 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01806 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01806 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01806 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01806 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01806 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01806 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01806 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms