Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
P01735 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01735 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01735 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01735 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01735 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01735 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01735 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01735 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01735 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01735 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01735 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01735 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01735 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01735 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01735 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01735 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01735 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01735 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01735 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01735 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01735 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01735 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01735 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01735 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01735 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01735 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01735 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01735 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01735 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01735 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01735 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01735 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01735 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01735 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01735 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01735 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01735 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01735 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01735 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01735 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01735 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01735 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01735 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01735 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01735 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01735 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01735 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01735 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01735 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01735 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01735 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01735 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01735 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01735 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01735 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01735 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01735 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01735 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01735 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01735 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01735 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01735 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01735 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01735 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01735 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01735 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01735 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01735 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01735 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01735 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01735 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01735 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01735 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01735 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01735 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01735 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P01735 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01735 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01735 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01735 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms