Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01656 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01656 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01656 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01656 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01656 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01656 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01656 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01656 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01656 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01656 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01656 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01656 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01656 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01656 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01656 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01656 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01656 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01656 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01656 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01656 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01656 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01656 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01656 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01656 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01656 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01656 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01656 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01656 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01656 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
P01656 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01656 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01656 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01656 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01656 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01656 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01656 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01656 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01656 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01656 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01656 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01656 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01656 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01656 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01656 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01656 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01656 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01656 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01656 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01656 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01656 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01656 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01656 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01656 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01656 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01656 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01656 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01656 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01656 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01656 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01656 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01656 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01656 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01656 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01656 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01656 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01656 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01656 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01656 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01656 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01656 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01656 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01656 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01656 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01656 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01656 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01656 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01656 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01656 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms