Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifna1P01572 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifna1P01572 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms