Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl20O89093 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Ccl20O89093 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Ccl20O89093 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl20O89093 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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