Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Setdb1O88974 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Setdb1O88974 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms