Protein–RNA interactions for Protein: O88952

Lin7c, Protein lin-7 homolog C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin7cO88952 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lin7cO88952 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin7cO88952 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin7cO88952 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin7cO88952 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin7cO88952 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin7cO88952 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin7cO88952 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin7cO88952 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin7cO88952 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin7cO88952 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lin7cO88952 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms