Protein–RNA interactions for Protein: O88848

Arl6, ADP-ribosylation factor-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6O88848 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arl6O88848 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arl6O88848 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms