Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops6O88545 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cops6O88545 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cops6O88545 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops6O88545 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops6O88545 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops6O88545 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops6O88545 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops6O88545 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops6O88545 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cops6O88545 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cops6O88545 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops6O88545 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops6O88545 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops6O88545 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms