Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfrO88507 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CntfrO88507 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfrO88507 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfrO88507 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfrO88507 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntfrO88507 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CntfrO88507 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CntfrO88507 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CntfrO88507 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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