Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tnnt1O88346 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnnt1O88346 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnnt1O88346 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms