Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nid2O88322 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nid2O88322 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nid2O88322 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nid2O88322 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nid2O88322 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nid2O88322 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nid2O88322 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nid2O88322 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nid2O88322 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nid2O88322 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nid2O88322 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms