Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfdp1O88271 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfdp1O88271 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms