Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CtssO70370 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtssO70370 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CtssO70370 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtssO70370 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtssO70370 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtssO70370 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtssO70370 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtssO70370 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtssO70370 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtssO70370 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtssO70370 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtssO70370 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtssO70370 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtssO70370 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtssO70370 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtssO70370 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtssO70370 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtssO70370 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CtssO70370 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CtssO70370 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtssO70370 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CtssO70370 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtssO70370 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtssO70370 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CtssO70370 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CtssO70370 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtssO70370 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CtssO70370 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtssO70370 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtssO70370 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtssO70370 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtssO70370 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CtssO70370 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtssO70370 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtssO70370 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CtssO70370 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtssO70370 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtssO70370 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CtssO70370 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtssO70370 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtssO70370 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtssO70370 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtssO70370 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtssO70370 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtssO70370 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtssO70370 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtssO70370 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtssO70370 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtssO70370 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtssO70370 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtssO70370 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CtssO70370 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtssO70370 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtssO70370 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtssO70370 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CtssO70370 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CtssO70370 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtssO70370 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtssO70370 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtssO70370 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtssO70370 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtssO70370 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtssO70370 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtssO70370 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtssO70370 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtssO70370 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtssO70370 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CtssO70370 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtssO70370 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtssO70370 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtssO70370 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CtssO70370 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms