Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb5O55234 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb5O55234 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms