Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Supt5hO55201 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Supt5hO55201 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Supt5hO55201 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms