Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tlx3O55144 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms