Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rpl35aO55142 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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