Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap1O55125 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms