Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syngr2O55101 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr2O55101 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr2O55101 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr2O55101 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr2O55101 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr2O55101 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr2O55101 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr2O55101 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr2O55101 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr2O55101 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr2O55101 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr2O55101 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr2O55101 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr2O55101 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr2O55101 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syngr2O55101 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syngr2O55101 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Syngr2O55101 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syngr2O55101 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syngr2O55101 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syngr2O55101 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Syngr2O55101 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syngr2O55101 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngr2O55101 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngr2O55101 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syngr2O55101 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngr2O55101 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngr2O55101 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngr2O55101 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syngr2O55101 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngr2O55101 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syngr2O55101 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Syngr2O55101 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Syngr2O55101 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Syngr2O55101 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngr2O55101 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syngr2O55101 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syngr2O55101 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngr2O55101 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syngr2O55101 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngr2O55101 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Syngr2O55101 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngr2O55101 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngr2O55101 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syngr2O55101 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Syngr2O55101 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Syngr2O55101 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngr2O55101 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Syngr2O55101 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngr2O55101 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngr2O55101 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Syngr2O55101 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngr2O55101 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Syngr2O55101 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngr2O55101 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Syngr2O55101 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngr2O55101 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngr2O55101 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngr2O55101 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Syngr2O55101 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms