Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms