Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NudcO35685 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NudcO35685 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NudcO35685 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NudcO35685 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NudcO35685 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NudcO35685 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NudcO35685 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NudcO35685 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NudcO35685 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NudcO35685 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NudcO35685 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NudcO35685 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NudcO35685 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NudcO35685 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NudcO35685 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NudcO35685 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NudcO35685 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NudcO35685 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NudcO35685 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NudcO35685 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NudcO35685 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NudcO35685 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NudcO35685 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NudcO35685 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NudcO35685 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NudcO35685 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NudcO35685 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NudcO35685 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NudcO35685 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NudcO35685 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NudcO35685 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NudcO35685 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NudcO35685 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NudcO35685 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NudcO35685 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NudcO35685 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NudcO35685 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NudcO35685 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NudcO35685 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NudcO35685 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NudcO35685 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NudcO35685 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NudcO35685 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NudcO35685 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NudcO35685 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NudcO35685 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NudcO35685 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NudcO35685 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NudcO35685 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NudcO35685 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NudcO35685 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NudcO35685 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NudcO35685 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NudcO35685 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NudcO35685 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NudcO35685 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NudcO35685 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NudcO35685 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NudcO35685 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NudcO35685 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NudcO35685 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NudcO35685 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NudcO35685 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NudcO35685 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NudcO35685 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NudcO35685 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NudcO35685 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NudcO35685 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NudcO35685 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NudcO35685 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NudcO35685 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NudcO35685 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NudcO35685 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NudcO35685 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NudcO35685 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NudcO35685 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NudcO35685 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NudcO35685 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NudcO35685 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NudcO35685 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NudcO35685 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NudcO35685 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NudcO35685 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NudcO35685 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NudcO35685 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NudcO35685 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NudcO35685 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NudcO35685 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NudcO35685 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NudcO35685 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NudcO35685 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NudcO35685 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NudcO35685 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NudcO35685 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NudcO35685 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NudcO35685 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NudcO35685 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NudcO35685 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NudcO35685 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms