Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Abcc1O35379 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Abcc1O35379 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Abcc1O35379 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms