Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pkd2O35245 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pkd2O35245 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms