Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad6O35182 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad6O35182 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad6O35182 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad6O35182 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad6O35182 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad6O35182 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms