Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kcns1O35173 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms