Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc23O35125 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc23O35125 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms